Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 H2-M10.6-201ENSMUST00000041398 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm42497-201ENSMUST00000197363 1958 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 D3Ertd751e-203ENSMUST00000108065 3452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Nudt13-201ENSMUST00000022343 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Cldn12-203ENSMUST00000115446 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm13571-202ENSMUST00000151984 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Eif2b3-202ENSMUST00000106447 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Fam90a1a-201ENSMUST00000110741 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Taf12-201ENSMUST00000030731 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Patj-207ENSMUST00000107034 4799 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Hoxd9P28357 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rtel1-202ENSMUST00000054622 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Map3k20-204ENSMUST00000135469 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxd9P28357 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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