Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
TsksO54887 Vmn1r89-207ENSMUST00000227390 1348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC155929.3-201ENSMUST00000217963 1428 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Opcml-202ENSMUST00000115243 6676 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ripor2-203ENSMUST00000091694 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gpatch2-206ENSMUST00000160471 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Stat2-202ENSMUST00000105238 4397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Trav5-4-201ENSMUST00000103664 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm15849-201ENSMUST00000159257 335 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ighv1-62-2-201ENSMUST00000163467 302 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Aldh3b3-202ENSMUST00000179433 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm29133-201ENSMUST00000189155 885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Krtdap-209ENSMUST00000190990 403 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Tdpoz2-201ENSMUST00000191960 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm5981-201ENSMUST00000199912 487 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm7492-201ENSMUST00000201745 725 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Cdh26-202ENSMUST00000108912 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 C9-201ENSMUST00000022749 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Prnd-204ENSMUST00000110172 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Pnpla1os-201ENSMUST00000146779 3946 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Slfn5-202ENSMUST00000108157 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Dkc1-201ENSMUST00000033776 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Nt5dc1-201ENSMUST00000047885 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gabrb2-201ENSMUST00000007797 3989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm13633-201ENSMUST00000120668 898 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 A330069K06Rik-201ENSMUST00000194077 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TsksO54887 Gm43069-201ENSMUST00000201006 859 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms