Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Serpina1b-201ENSMUST00000095450 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Olfr975-202ENSMUST00000216647 2848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm8814-201ENSMUST00000119072 535 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm15694-201ENSMUST00000121984 283 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm3591-202ENSMUST00000179312 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Hcfc1r1-202ENSMUST00000179928 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Platr11-201ENSMUST00000182885 388 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm2693-201ENSMUST00000189119 571 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm45436-201ENSMUST00000210729 469 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm19612-201ENSMUST00000218279 982 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Olfr691-201ENSMUST00000057528 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Calr4-203ENSMUST00000106629 1583 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Olfr212-202ENSMUST00000218028 2291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Smim18J3QNP2 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm4275-205ENSMUST00000212624 1436 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 D330041H03Rik-207ENSMUST00000181760 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm25594-201ENSMUST00000102274 82 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm23266-201ENSMUST00000104444 134 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Krtap29-1-201ENSMUST00000105051 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm14813-201ENSMUST00000122291 395 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 4930439A04Rik-201ENSMUST00000137241 739 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm28478-201ENSMUST00000185802 183 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm29572-201ENSMUST00000190305 283 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Gm44790-201ENSMUST00000204137 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 CT030657.4-201ENSMUST00000222177 744 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 CT025630.3-201ENSMUST00000228798 835 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Pla2g12a-202ENSMUST00000061165 476 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Smim18J3QNP2 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms