Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Depdc5-204ENSMUST00000119705 7929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chid1-203ENSMUST00000118694 3910 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Havcr1-201ENSMUST00000047568 1892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr87-203ENSMUST00000200095 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmaa-201ENSMUST00000048718 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sun3-201ENSMUST00000043377 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hibch-201ENSMUST00000044478 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31152-201ENSMUST00000210319 2171 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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