Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Klhl32-203ENSMUST00000108214 5970 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Lyve1-201ENSMUST00000033050 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ocln-202ENSMUST00000069756 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Vmn1r51-204ENSMUST00000226977 4357 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Mkl2-201ENSMUST00000009713 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ttc26-205ENSMUST00000162554 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ank3-247ENSMUST00000218680 5500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm42700-201ENSMUST00000199071 2437 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Zc3h12c-201ENSMUST00000165519 6133 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Fmn1-203ENSMUST00000102547 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps30-201ENSMUST00000176032 948 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 1700034J04Rik-201ENSMUST00000192736 750 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm18860-201ENSMUST00000212029 764 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 AC133598.3-204ENSMUST00000224260 767 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Pcyt1a-203ENSMUST00000115137 4244 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Dip2b-201ENSMUST00000023768 4323 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm17833-201ENSMUST00000197629 1065 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Olfr451-ps1-201ENSMUST00000205127 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Ddx6-203ENSMUST00000217034 6029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Atg3Q9CPX6 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms