Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 4930404I05Rik-201ENSMUST00000125902 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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PtprtQ99M80 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Ncaph2-203ENSMUST00000088717 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Rcbtb2-209ENSMUST00000164822 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
PtprtQ99M80 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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