Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 1700034I23Rik-201ENSMUST00000099123 2348 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Adgrl3-208ENSMUST00000118442 5101 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Limk2-203ENSMUST00000101642 3693 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Zfp677-202ENSMUST00000162659 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm16026-206ENSMUST00000163068 2741 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd55-203ENSMUST00000165593 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ptbp3-210ENSMUST00000173699 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 6430562O15Rik-202ENSMUST00000180808 3997 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm22533-201ENSMUST00000158821 274 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm45766-201ENSMUST00000211900 478 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Zfp866-201ENSMUST00000131784 2680 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Fmnl1-203ENSMUST00000107027 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Adgrl3-218ENSMUST00000122037 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Lilra6-204ENSMUST00000206077 2281 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ldb2-207ENSMUST00000199534 2541 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Deptor-202ENSMUST00000096433 8547 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm11690-201ENSMUST00000128183 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ank3-219ENSMUST00000182437 3113 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Pi4kb-203ENSMUST00000125476 3400 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC8.46□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Napepld-201ENSMUST00000060899 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Rdh12-201ENSMUST00000021548 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Bicc1-202ENSMUST00000131445 3005 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Ube2q1Q7TSS2 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Ube2q1Q7TSS2 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms