Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm43681-201ENSMUST00000201581 1903 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gmfg-202ENSMUST00000108289 477 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 1700047G07Rik-202ENSMUST00000212351 842 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 4933416E14Rik-202ENSMUST00000137955 1938 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm31881-202ENSMUST00000199455 559 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm4796-201ENSMUST00000219802 624 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC161877.2-201ENSMUST00000226248 545 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Trim43c-201ENSMUST00000163255 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Zrsr1-201ENSMUST00000049506 3282 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms