Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Tssk4-206ENSMUST00000228041 1217 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r218-201ENSMUST00000074992 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-201ENSMUST00000086535 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Sft2d1Q5SSN7 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Xlr5c-202ENSMUST00000114503 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Dtwd1-202ENSMUST00000170908 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10224-201ENSMUST00000119496 615 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s43-201ENSMUST00000122739 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm16238-201ENSMUST00000159343 586 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm20451-201ENSMUST00000173452 273 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm25306-201ENSMUST00000175288 117 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28286-201ENSMUST00000188704 586 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr444-201ENSMUST00000095955 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tmod2-206ENSMUST00000215036 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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