Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrc43Q3V0L5 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Lrrc43Q3V0L5 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Mb21d2-201ENSMUST00000100023 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrc43Q3V0L5 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Lrrc43Q3V0L5 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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