Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ppp1r9a-204ENSMUST00000168998 2966 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm24422-201ENSMUST00000157800 119 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tecr-202ENSMUST00000163837 1272 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC130673.1-201ENSMUST00000227992 435 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm44950-201ENSMUST00000206403 2296 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Itgam-202ENSMUST00000106240 3325 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm45017-201ENSMUST00000206842 1777 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Ccr4-201ENSMUST00000054414 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm29483-201ENSMUST00000188188 1078 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
Trim71Q1PSW8 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
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