Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm37623-201ENSMUST00000193691 803 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm43805-201ENSMUST00000198488 824 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm18973-201ENSMUST00000205814 511 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC207128.1-201ENSMUST00000225928 799 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Ms4a6d-201ENSMUST00000025582 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm42771-201ENSMUST00000198342 2486 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC8.59□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Frrs1-202ENSMUST00000195905 6823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm28670-201ENSMUST00000185365 1498 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm29537-202ENSMUST00000186153 1498 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm29497-201ENSMUST00000186801 1498 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm28568-201ENSMUST00000187762 1498 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm29445-202ENSMUST00000189947 1497 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm28458-202ENSMUST00000190542 1497 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm28457-202ENSMUST00000191277 1498 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37654-201ENSMUST00000193019 1498 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
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Sh3bp1P55194 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
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Sh3bp1P55194 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm29577-201ENSMUST00000186427 693 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm38164-201ENSMUST00000192810 330 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gpx4-ps2-202ENSMUST00000217344 782 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm15433-201ENSMUST00000097671 891 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Mmp3-201ENSMUST00000034497 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Gm44014-201ENSMUST00000205150 1509 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Sec16b-203ENSMUST00000111700 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 Zfp952-201ENSMUST00000087666 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Sh3bp1P55194 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.8 ms