Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 5830408C22Rik-204ENSMUST00000211653 351 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tmem156-205ENSMUST00000212194 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr319-201ENSMUST00000076965 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tmem161b-206ENSMUST00000225069 2414 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm5118-201ENSMUST00000184692 2203 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Clec12b-202ENSMUST00000112082 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43409-201ENSMUST00000195921 2162 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gsdma2-202ENSMUST00000093938 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm29041-201ENSMUST00000189199 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm37282-201ENSMUST00000191987 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm37665-201ENSMUST00000192353 149 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43835-201ENSMUST00000195932 149 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43535-201ENSMUST00000197846 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gabra4-203ENSMUST00000198138 440 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm44379-201ENSMUST00000204501 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm44268-201ENSMUST00000204814 164 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm8838-201ENSMUST00000212978 541 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC166574.2-201ENSMUST00000226751 381 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Ghrh-201ENSMUST00000029172 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Spag11a-201ENSMUST00000058955 436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Fabp5l2-201ENSMUST00000072582 408 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms