Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm27509-201ENSMUST00000102400 79 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Rhox4c-201ENSMUST00000115183 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11399-201ENSMUST00000131021 324 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm15520-201ENSMUST00000132097 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930553I04Rik-201ENSMUST00000196722 670 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tatdn3-202ENSMUST00000085633 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mapk8-205ENSMUST00000111945 5756 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Cdk1-201ENSMUST00000020099 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm15873-201ENSMUST00000123390 761 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr330-201ENSMUST00000134055 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Btnl5-ps-202ENSMUST00000173333 461 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm9286-201ENSMUST00000173586 508 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm42864-201ENSMUST00000198371 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm19683-201ENSMUST00000209748 1781 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Olfr960-203ENSMUST00000216584 1148 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC211878.7-201ENSMUST00000222851 661 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rnf4Q9QZS2 AC113178.1-201ENSMUST00000227616 935 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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