Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Akt3-201ENSMUST00000019843 1511 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Slc34a1-205ENSMUST00000225259 3983 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm12111-201ENSMUST00000150073 349 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Adgrl2-213ENSMUST00000199059 4637 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ccl24-202ENSMUST00000201401 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm45725-201ENSMUST00000212962 337 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Unc80-201ENSMUST00000061620 13613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Celf5-204ENSMUST00000120856 3861 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm24869-201ENSMUST00000104072 128 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Xpo7-206ENSMUST00000228346 4491 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Klf12-205ENSMUST00000228216 5890 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Prps2-201ENSMUST00000026839 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
OtofQ9ESF1 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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