Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr1303-201ENSMUST00000099609 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Lpp-201ENSMUST00000038053 15647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 A230059L01Rik-201ENSMUST00000126596 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Kctd16-201ENSMUST00000091927 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Ssr3-201ENSMUST00000029414 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm16050-201ENSMUST00000160626 2363 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 4930534H03Rik-201ENSMUST00000216311 1669 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Lonp2-202ENSMUST00000121673 1550 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Ggact-204ENSMUST00000161322 524 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 1700104L18Rik-201ENSMUST00000220132 598 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr466-201ENSMUST00000058907 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr702-204ENSMUST00000219803 1646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Dkc1-201ENSMUST00000033776 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Ankrd49-201ENSMUST00000034406 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gimap4-201ENSMUST00000067506 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Cacng5-202ENSMUST00000106742 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm26628-201ENSMUST00000181028 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm26408-201ENSMUST00000157672 127 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm18349-201ENSMUST00000187440 904 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 5430433H01Rik-201ENSMUST00000193978 542 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm18619-201ENSMUST00000222722 1147 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Clstn1Q9EPL2 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms