Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14061-201ENSMUST00000155923 1007 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29811-201ENSMUST00000197386 1671 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nr3c2-201ENSMUST00000034031 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ogfod1-201ENSMUST00000060632 5214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700056N10Rik-201ENSMUST00000141875 1043 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26812-202ENSMUST00000181776 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18362-201ENSMUST00000221786 529 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC166822.2-201ENSMUST00000228746 275 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr51-201ENSMUST00000076514 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43158-201ENSMUST00000198484 1555 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Nhlrc3Q8CCH2 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms