Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Usp47Q8BY87 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp47Q8BY87 9130409I23Rik-201ENSMUST00000036819 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Usp47Q8BY87 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm37200-201ENSMUST00000193689 2172 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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Usp47Q8BY87 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Usp47Q8BY87 Ighv1-63-201ENSMUST00000103534 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Usp47Q8BY87 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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