Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC165281.1-201ENSMUST00000225713 1011 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Usp54-202ENSMUST00000035340 6495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Ankfn1-203ENSMUST00000169201 2232 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 4931406P16Rik-210ENSMUST00000206399 4158 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Adgrl3-205ENSMUST00000117985 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Adgrl3-212ENSMUST00000120144 4999 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Crb1-202ENSMUST00000196402 2711 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC168056.4-201ENSMUST00000223835 2567 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Mybbp1a-201ENSMUST00000045633 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Dennd6a-205ENSMUST00000224378 2424 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Ccl20-201ENSMUST00000027351 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Ptpn13-201ENSMUST00000048957 7915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm12967-201ENSMUST00000122147 289 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 2810403D21Rik-201ENSMUST00000123040 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC122533.2-201ENSMUST00000223772 545 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr1509-201ENSMUST00000045066 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Ncoa7-209ENSMUST00000216172 2026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Casr-202ENSMUST00000114847 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm29311-202ENSMUST00000189721 1532 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
GcsamQ6RFH4 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms