Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm5789-201ENSMUST00000222643 865 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Spag11a-201ENSMUST00000058955 436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Havcr1-203ENSMUST00000109223 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Abhd4-202ENSMUST00000180359 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cd99l2-201ENSMUST00000037391 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 L1td1-202ENSMUST00000154279 2942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 9330162B11Rik-201ENSMUST00000195397 2212 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Arpp21-203ENSMUST00000111872 3316 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Arpp21-229ENSMUST00000164754 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm36879-201ENSMUST00000212313 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Cd300ld-201ENSMUST00000045075 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Prdm15-201ENSMUST00000095849 6346 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm43657-201ENSMUST00000200336 3833 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC138716.1-201ENSMUST00000226350 2959 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Zfp74-201ENSMUST00000032797 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Txnip-202ENSMUST00000074519 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mageb2-202ENSMUST00000201779 1551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Eps15-202ENSMUST00000102729 5190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14561-201ENSMUST00000117376 798 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm14032-201ENSMUST00000117686 1026 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm11604-201ENSMUST00000121487 742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Anp32b-ps1-201ENSMUST00000122215 758 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Glyatl3-201ENSMUST00000166343 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm26590-201ENSMUST00000180857 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Galntl6-205ENSMUST00000188531 1056 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Spa17-201ENSMUST00000002013 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC140210.1-201ENSMUST00000224961 534 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Fgf21-201ENSMUST00000033099 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rab3b-201ENSMUST00000003502 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 1700001C19Rik-202ENSMUST00000073143 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 CT009757.2-201ENSMUST00000220806 2028 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm10482-202ENSMUST00000189825 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Dhcr7-207ENSMUST00000141916 2752 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Plec-208ENSMUST00000080857 14959 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Nav2-216ENSMUST00000184945 10665 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Rian-202ENSMUST00000181253 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Stn1-207ENSMUST00000182808 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 4930578I07Rik-201ENSMUST00000193416 1372 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Pbrm1-204ENSMUST00000090214 6212 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm37315-201ENSMUST00000194347 3479 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 A730065G17Rik-201ENSMUST00000217082 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Glra4-201ENSMUST00000018739 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Clcn1Q64347 Zfp541-203ENSMUST00000210805 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms