Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 1110008L16Rik-202ENSMUST00000183475 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 4933436H12Rik-203ENSMUST00000207818 1466 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm38414-201ENSMUST00000209819 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Churc1-202ENSMUST00000110399 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm17572-201ENSMUST00000171455 420 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm19705-201ENSMUST00000180495 496 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm26623-201ENSMUST00000180911 850 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm44203-201ENSMUST00000203134 307 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Dppa5b-201ENSMUST00000214261 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Dppa5c-201ENSMUST00000216268 348 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm6150-201ENSMUST00000217775 577 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 AC112259.1-201ENSMUST00000222891 853 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Brd8-204ENSMUST00000115766 4258 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Rbx1-201ENSMUST00000023036 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Fbxw7-202ENSMUST00000107675 3599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Btbd16-201ENSMUST00000048453 3434 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Atxn3-201ENSMUST00000021606 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Extl2-202ENSMUST00000106501 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gbx1P82976 Pcmtd2-201ENSMUST00000029116 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms