Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm12455-201ENSMUST00000121242 416 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm12925-201ENSMUST00000130791 678 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Sumo2-207ENSMUST00000153892 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm15699-201ENSMUST00000159213 280 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm7863-201ENSMUST00000184700 805 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm27283-201ENSMUST00000184853 323 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 1700065J18Rik-202ENSMUST00000190576 387 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 1700009C05Rik-201ENSMUST00000191101 788 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Abracl-201ENSMUST00000020002 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm17768-201ENSMUST00000201257 378 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm45824-201ENSMUST00000212236 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC108846.3-201ENSMUST00000214078 247 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC154028.1-201ENSMUST00000217071 379 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm34278-201ENSMUST00000220534 622 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 1700066J03Rik-202ENSMUST00000224280 516 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Ackr1-201ENSMUST00000038227 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Srp54a-201ENSMUST00000021407 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Dixdc1-206ENSMUST00000120622 1379 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Cep19-201ENSMUST00000042869 1567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Dppa1-201ENSMUST00000077173 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Zfp661-201ENSMUST00000077422 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 9230112J17Rik-201ENSMUST00000216749 2333 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Sirpb1c-202ENSMUST00000108349 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Vpreb1P13372 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 E130120K24Rik-201ENSMUST00000129910 556 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm13415-202ENSMUST00000135829 565 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Cox6c-201ENSMUST00000014457 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm16238-201ENSMUST00000159343 586 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm20451-201ENSMUST00000173452 273 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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