Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm7162-201ENSMUST00000161205 1024 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Rnf141-210ENSMUST00000177462 859 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm21886-201ENSMUST00000178391 645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm5696-201ENSMUST00000189850 552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm36241-201ENSMUST00000201085 493 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm6375-201ENSMUST00000205201 1145 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 AC118476.4-201ENSMUST00000215385 790 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Ptgfr-202ENSMUST00000106126 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Cxcl5-201ENSMUST00000031318 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr571-202ENSMUST00000214160 4999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Hivep3-202ENSMUST00000106307 11838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Trav15-2-dv6-2-201ENSMUST00000103660 370 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm13071-201ENSMUST00000122237 376 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Bloodlinc-201ENSMUST00000126237 679 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Crem-229ENSMUST00000151084 957 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms