Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Olfr818-201ENSMUST00000074308 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Pcdhga1-202ENSMUST00000194888 3247 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm4491-201ENSMUST00000159455 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm2233-201ENSMUST00000222566 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Adra1a-201ENSMUST00000054661 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm42895-201ENSMUST00000200761 2996 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 4930428N03Rik-204ENSMUST00000224456 3212 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TsksO54887 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Abhd4-202ENSMUST00000180359 2508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm26792-201ENSMUST00000180538 2799 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Serpina3f-202ENSMUST00000121337 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Cldn18-201ENSMUST00000035048 4172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 CT009723.1-201ENSMUST00000215057 1803 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Cd99l2-203ENSMUST00000114586 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm43465-201ENSMUST00000200367 2802 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Neu3-201ENSMUST00000036331 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Igkv6-25-201ENSMUST00000103383 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm16031-201ENSMUST00000153253 448 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Zfp637-211ENSMUST00000223041 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Guca2a-201ENSMUST00000024015 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm42848-201ENSMUST00000201477 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Ep400-203ENSMUST00000112435 10420 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Bbs9-211ENSMUST00000150395 3425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TsksO54887 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm45821-201ENSMUST00000211967 1757 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 AC160118.1-201ENSMUST00000214497 2457 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Vps8-206ENSMUST00000118923 4838 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Tdpoz1-201ENSMUST00000094413 2237 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
TsksO54887 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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