Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Rpl35a-203ENSMUST00000115076 519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Anp32e-207ENSMUST00000170125 413 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC107452.2-201ENSMUST00000228415 363 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Vmn1r90-209ENSMUST00000227855 7362 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Dennd2c-204ENSMUST00000173206 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC154806.2-201ENSMUST00000227212 2385 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Zfp280d-203ENSMUST00000183410 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm26209-201ENSMUST00000103852 110 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm18353-201ENSMUST00000185906 784 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm29485-201ENSMUST00000190220 282 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 1700094M23Rik-201ENSMUST00000197695 695 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm35274-201ENSMUST00000217709 646 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm19161-201ENSMUST00000217958 737 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gzma-202ENSMUST00000224282 996 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Olfr649-201ENSMUST00000060440 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gzmk-202ENSMUST00000122399 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Gm20795J3QP49 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms