Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Eya3-201ENSMUST00000020197 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 AC160413.2-201ENSMUST00000217790 2280 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Hcar1-201ENSMUST00000164267 3285 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm20679-201ENSMUST00000177285 1402 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm38012-201ENSMUST00000193022 3029 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Samd3-201ENSMUST00000060716 1874 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Serinc3-201ENSMUST00000017851 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Mtmr6-201ENSMUST00000022563 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 4930503E24Rik-201ENSMUST00000219167 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Fshb-201ENSMUST00000028533 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Zfp658-202ENSMUST00000107972 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Nron-203ENSMUST00000156297 3340 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Pilrb2-201ENSMUST00000164886 1807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm45861-201ENSMUST00000209669 7184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Slc1a1-201ENSMUST00000025875 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Mum1l1-203ENSMUST00000113043 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Cpt1a-201ENSMUST00000025835 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Hk1-203ENSMUST00000116238 3851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Jade1-206ENSMUST00000191952 3327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Ttc41-205ENSMUST00000219108 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm12120-201ENSMUST00000125068 592 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm20072-201ENSMUST00000202231 292 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Hdac5Q9Z2V6 Anxa10-201ENSMUST00000034052 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Patl2-201ENSMUST00000028665 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Prkaa2-201ENSMUST00000030243 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr92-203ENSMUST00000216341 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Fam168a-201ENSMUST00000049053 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gigyf2-217ENSMUST00000174501 3876 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm7942-201ENSMUST00000163216 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Lin7a-201ENSMUST00000020057 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Ddx5-201ENSMUST00000021062 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 AC136986.2-201ENSMUST00000220880 2944 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 4930466I24Rik-201ENSMUST00000144105 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Mapre2-201ENSMUST00000025127 4026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm42444-201ENSMUST00000199366 4558 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr170-202ENSMUST00000206562 1417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Mamdc4-201ENSMUST00000095117 3990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Ablim1-205ENSMUST00000111526 2164 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm12288-201ENSMUST00000121054 1282 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 E330017L17Rik-204ENSMUST00000145196 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hdac5Q9Z2V6 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms