Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr655-201ENSMUST00000057385 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tanc1-203ENSMUST00000112568 7422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ppip5k1-204ENSMUST00000110627 5494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Ano1-203ENSMUST00000121758 4552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Dcstamp-204ENSMUST00000227792 1367 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gsdmc3-203ENSMUST00000190682 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Cpsf1-201ENSMUST00000071898 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm19127-201ENSMUST00000207067 2445 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Sdhc-202ENSMUST00000111336 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Halr1-202ENSMUST00000155758 408 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20852-201ENSMUST00000178761 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21394-201ENSMUST00000179523 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Trim35Q8C006 Gm20806-201ENSMUST00000180324 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm26639-201ENSMUST00000181426 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20847-201ENSMUST00000186066 678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20930-201ENSMUST00000186998 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21771-201ENSMUST00000188693 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20913-201ENSMUST00000189188 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21573-201ENSMUST00000190112 691 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20848-201ENSMUST00000190836 678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21755-201ENSMUST00000191507 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21791-201ENSMUST00000191631 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21845-201ENSMUST00000191848 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21890-201ENSMUST00000195190 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm21350-201ENSMUST00000195678 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trim35Q8C006 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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