Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm17032-201ENSMUST00000164367 338 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm43571-201ENSMUST00000200067 3098 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Baz2a-202ENSMUST00000170054 8372 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Baz2a-201ENSMUST00000045621 8369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Rdh16-201ENSMUST00000071646 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Nudt7-202ENSMUST00000073521 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Tecpr2-202ENSMUST00000169597 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Vmn1r37-205ENSMUST00000227923 1773 ntAPPRIS P2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Rnmt-201ENSMUST00000009679 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm37907-201ENSMUST00000195644 846 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC154692.1-202ENSMUST00000226632 1231 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ank3-203ENSMUST00000092431 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ube4a-204ENSMUST00000138559 3374 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Prdm15-203ENSMUST00000121584 6194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Siah1bQ06985 Alpk1-201ENSMUST00000029662 4795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms