Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Parp9-201ENSMUST00000023622 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Raet1d-202ENSMUST00000182677 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Nlrp9a-203ENSMUST00000117252 2796 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 1700030O20Rik-201ENSMUST00000185546 594 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Klk1b2-ps-201ENSMUST00000206099 786 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm5173-201ENSMUST00000219616 950 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm8153-201ENSMUST00000219844 952 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm17359-203ENSMUST00000199658 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Rbms3-207ENSMUST00000164018 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC155234.1-201ENSMUST00000225610 2823 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm5530-201ENSMUST00000117185 985 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Stard6-202ENSMUST00000164223 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
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Sh3bp1P55194 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm42525-201ENSMUST00000196257 527 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm42745-201ENSMUST00000200904 193 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm8616-201ENSMUST00000222175 1037 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC123058.1-201ENSMUST00000223748 437 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Olfr608-201ENSMUST00000213546 1482 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Adgrl3-211ENSMUST00000120128 6370 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm9894-201ENSMUST00000171257 2904 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm45512-201ENSMUST00000210432 1553 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Kbtbd8os-201ENSMUST00000135145 427 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Sh3bp1P55194 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
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