Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm24542-201ENSMUST00000103870 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm25095-201ENSMUST00000104047 131 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm23706-201ENSMUST00000104369 82 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm26344-201ENSMUST00000104553 132 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm13944-202ENSMUST00000146495 542 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm13833-201ENSMUST00000146766 719 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 S100a10-203ENSMUST00000170612 477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Uchl1os-202ENSMUST00000177319 505 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm23403-201ENSMUST00000179169 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 1190005I06Rik-203ENSMUST00000180677 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm29491-201ENSMUST00000189481 506 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Olfr1392-201ENSMUST00000189851 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ighv8-16-201ENSMUST00000199258 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Tpi-rs11-201ENSMUST00000202145 310 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC153937.2-202ENSMUST00000219583 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ryk-ps1-201ENSMUST00000219713 235 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC167202.2-201ENSMUST00000220155 296 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Allc-201ENSMUST00000020965 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC153143.1-201ENSMUST00000222966 1340 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
TtrP07309 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TtrP07309 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TtrP07309 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TtrP07309 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TtrP07309 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TtrP07309 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TtrP07309 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TtrP07309 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm13005-201ENSMUST00000119518 585 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Gm11953-201ENSMUST00000122352 1003 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TtrP07309 4930401O10Rik-201ENSMUST00000128489 787 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms