Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssr1-201ENSMUST00000021864 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1e-201ENSMUST00000004214 12697 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12773-201ENSMUST00000120134 587 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15481-201ENSMUST00000120264 539 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Halr1-201ENSMUST00000125374 391 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43786-202ENSMUST00000202157 616 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr905-201ENSMUST00000051111 937 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10160-201ENSMUST00000085094 201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kidins220-210ENSMUST00000222941 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833407H14Rik-201ENSMUST00000180442 1485 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ikbkg-206ENSMUST00000114130 6736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc12-202ENSMUST00000168129 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sipa1l1-201ENSMUST00000053969 7488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam114a1-201ENSMUST00000031080 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb5-202ENSMUST00000084662 3302 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5316-202ENSMUST00000185734 3096 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r26-202ENSMUST00000228040 4546 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6a-201ENSMUST00000019791 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11653-201ENSMUST00000119992 1009 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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