Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Use1Q9CQ56 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Use1Q9CQ56 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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