Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Hps1-202ENSMUST00000069298 3196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Gm26739-201ENSMUST00000181041 427 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Scgb1b18-201ENSMUST00000191255 402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm3364-201ENSMUST00000196016 1217 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm44773-201ENSMUST00000207374 557 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm4303-201ENSMUST00000218922 910 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms