Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Tmem267-201ENSMUST00000099147 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Olfr1124-202ENSMUST00000215909 2422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Ace2-201ENSMUST00000073973 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cux1P53564 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm4525-201ENSMUST00000198831 254 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Olfr1361-201ENSMUST00000055615 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 1700102P08Rik-202ENSMUST00000192995 658 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Olfr1214-202ENSMUST00000216026 2126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Ptpro-207ENSMUST00000203914 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Washc2-201ENSMUST00000036759 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cux1P53564 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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