Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Cyb5r2-202ENSMUST00000208217 1178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm10860-201ENSMUST00000176934 1888 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Cd84-203ENSMUST00000135386 3434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Igkv4-72-201ENSMUST00000103346 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm13683-201ENSMUST00000119497 1076 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm6004-201ENSMUST00000173237 1116 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm8696-201ENSMUST00000174777 385 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm8167-201ENSMUST00000183320 958 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 AC121286.2-201ENSMUST00000218069 2470 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ighv1-9-201ENSMUST00000103498 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
H2-Eb1P04230 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms