Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Synj2-208ENSMUST00000115789 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr1425-202ENSMUST00000214918 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26025-201ENSMUST00000158655 271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm38373-201ENSMUST00000192042 288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Efr3a-213ENSMUST00000211878 2541 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Umps-201ENSMUST00000023510 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gpr152-201ENSMUST00000096338 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Taok3-210ENSMUST00000179276 4302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AC155270.1-202ENSMUST00000221503 352 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm15903-202ENSMUST00000199631 3518 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr443-ps1-202ENSMUST00000204422 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Cdh23-204ENSMUST00000105463 10991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 E230020D15Rik-201ENSMUST00000208097 5899 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm29028-201ENSMUST00000186297 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28352-201ENSMUST00000186654 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28972-201ENSMUST00000186990 2167 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm29302-201ENSMUST00000187209 2167 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28866-201ENSMUST00000187298 2167 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28878-201ENSMUST00000188272 2167 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28246-201ENSMUST00000188308 2167 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28823-201ENSMUST00000188540 2167 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm29046-201ENSMUST00000188653 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm28346-201ENSMUST00000189021 2167 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr535-201ENSMUST00000074897 991 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ccdc180J3QNE4 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms