Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm12003-201ENSMUST00000118518 1105 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm13653-201ENSMUST00000122260 483 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm11377-201ENSMUST00000131539 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm8340-201ENSMUST00000165508 1191 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm21454-201ENSMUST00000178599 1285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm9169-201ENSMUST00000182930 536 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 1700030L20Rik-201ENSMUST00000189233 985 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Etv3l-201ENSMUST00000193196 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 4930500F04Rik-203ENSMUST00000202177 576 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm6869-201ENSMUST00000220334 734 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 CT030664.1-201ENSMUST00000223639 908 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Ermard-210ENSMUST00000226599 788 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Lyg1-201ENSMUST00000027254 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Mcm7-201ENSMUST00000000505 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr15-201ENSMUST00000080917 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm9104-201ENSMUST00000095268 483 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Hacl1-202ENSMUST00000127204 1699 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 BC025920-203ENSMUST00000119753 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Orc1-201ENSMUST00000102744 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 G6pc2-201ENSMUST00000005364 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Sh2d2a-201ENSMUST00000029709 4484 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Rai14-202ENSMUST00000169385 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Taf9b-202ENSMUST00000113495 2512 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm12093-201ENSMUST00000120906 1405 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm10472-201ENSMUST00000193014 2102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Nnt-202ENSMUST00000099149 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm17473-202ENSMUST00000228544 2071 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Olfr1221-204ENSMUST00000217635 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Ap1b1-202ENSMUST00000101613 3735 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm28038F7BCN9 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms