Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm43280-201ENSMUST00000202958 1550 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm5393-201ENSMUST00000119106 272 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm12989-201ENSMUST00000122331 731 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm25842-201ENSMUST00000122590 322 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm23598-201ENSMUST00000157262 144 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm17042-201ENSMUST00000167075 1216 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm9476-201ENSMUST00000179109 696 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Slc35a5-205ENSMUST00000181177 865 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AF067061-202ENSMUST00000181748 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm7863-201ENSMUST00000184700 805 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC124577.1-201ENSMUST00000214044 487 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm32220-201ENSMUST00000218420 298 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC163038.3-201ENSMUST00000223945 558 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 CT025603.3-201ENSMUST00000224031 419 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC118250.2-201ENSMUST00000228890 416 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Klk4-201ENSMUST00000007161 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm15328-204ENSMUST00000210330 1518 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Alpk2-201ENSMUST00000035548 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Tpx2-207ENSMUST00000178997 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 AC102431.2-201ENSMUST00000224071 2448 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Prc1-210ENSMUST00000174172 3008 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Hist1h4h-201ENSMUST00000102972 470 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm14188-201ENSMUST00000105060 168 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Fam166b-202ENSMUST00000107928 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm14911-201ENSMUST00000120803 989 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm14425-201ENSMUST00000121240 606 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm13360-201ENSMUST00000121607 799 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm40-201ENSMUST00000122131 660 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm14260-201ENSMUST00000125121 260 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm15627-201ENSMUST00000140421 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm15221-201ENSMUST00000144439 414 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm14487-201ENSMUST00000145413 1259 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 4833417C18Rik-201ENSMUST00000146868 1269 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm25767-201ENSMUST00000158572 124 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm23823-201ENSMUST00000158740 124 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm16494-201ENSMUST00000165525 261 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm27150-201ENSMUST00000183441 1038 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm27228-201ENSMUST00000184500 1038 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm29453-201ENSMUST00000186428 1279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm29471-201ENSMUST00000190527 700 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm36398-201ENSMUST00000192255 696 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm30312-201ENSMUST00000194516 696 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm43693-201ENSMUST00000196072 1249 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Tspan4Q9DCK3 Gm42794-201ENSMUST00000197636 835 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms