Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC113031.6-202ENSMUST00000228468 1145 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rin3-204ENSMUST00000133820 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Kpna3-201ENSMUST00000022496 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ermard-201ENSMUST00000040594 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ndst3-206ENSMUST00000154668 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Fmo5-202ENSMUST00000107049 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rab2b-202ENSMUST00000100631 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr1426-206ENSMUST00000219996 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Epn2-212ENSMUST00000178202 4317 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ccdc127-203ENSMUST00000160021 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Hrh1-203ENSMUST00000160780 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tdrd1-204ENSMUST00000121249 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm12879-201ENSMUST00000120003 1182 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Usp54Q8BL06 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms