Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm9354-201ENSMUST00000209075 468 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm7328-201ENSMUST00000211123 2225 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Utrn-204ENSMUST00000217994 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm15925-201ENSMUST00000120641 1881 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Cd84-204ENSMUST00000136479 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Sf3b3-201ENSMUST00000042012 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Hcar1-201ENSMUST00000164267 3285 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC115744.1-201ENSMUST00000222398 2379 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Fam228a-204ENSMUST00000222363 2284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Pcbp2-202ENSMUST00000078404 2829 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC154461.2-201ENSMUST00000225462 1980 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Wipf3-206ENSMUST00000172046 4204 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 2700046A07Rik-202ENSMUST00000067450 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC125074.1-201ENSMUST00000227970 1331 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm7682-202ENSMUST00000202916 1582 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Oprm1-217ENSMUST00000105615 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mrpl48-ps-201ENSMUST00000121413 636 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Scgb1b28-ps-201ENSMUST00000163647 290 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28918-201ENSMUST00000188822 699 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37376-201ENSMUST00000192176 453 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37491-201ENSMUST00000192552 1111 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm43934-201ENSMUST00000205095 388 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr362-203ENSMUST00000215927 1210 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC124687.3-201ENSMUST00000222865 875 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC107711.5-201ENSMUST00000228149 594 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Defa37-201ENSMUST00000084040 403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gsap-201ENSMUST00000036031 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mmp19-201ENSMUST00000026411 3402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Atg7-202ENSMUST00000169310 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Hist2h2be-201ENSMUST00000090781 2620 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Lppos-201ENSMUST00000181640 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37949-201ENSMUST00000192808 2091 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Synj2-205ENSMUST00000115786 2531 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms