Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Slc1a1-201ENSMUST00000025875 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm14668-201ENSMUST00000118588 1724 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 AC132336.1-201ENSMUST00000222844 1740 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Sptbn1-202ENSMUST00000011877 8238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm29671-201ENSMUST00000189438 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Acbd5-201ENSMUST00000028121 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Cyp2d22-201ENSMUST00000023083 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Abr-204ENSMUST00000108407 4811 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Lig3-203ENSMUST00000092849 4560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ubqln3-201ENSMUST00000057254 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Wdr5b-201ENSMUST00000042203 1784 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Rad51b-201ENSMUST00000079533 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Zfp169-207ENSMUST00000177530 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 Gm10639-202ENSMUST00000121273 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm13999-201ENSMUST00000141511 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 5033426E14Rik-201ENSMUST00000212462 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 Zfp820-201ENSMUST00000084141 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 BC039771-202ENSMUST00000144661 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 Bgn-201ENSMUST00000033741 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Zbtb38Q3LR78 Tmem170b-201ENSMUST00000129449 7168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ubap2l-220ENSMUST00000199834 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Zbtb38Q3LR78 Gm15742-201ENSMUST00000123905 659 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms