Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Ndufa7-201ENSMUST00000048249 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Alkbh8-201ENSMUST00000053407 3603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 CT009718.2-201ENSMUST00000221408 1428 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gfi1P70338 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Szt2-201ENSMUST00000075406 10965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mup1-202ENSMUST00000103012 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 AC137950.1-201ENSMUST00000228553 515 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 9130023H24Rik-201ENSMUST00000078816 3574 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gfi1P70338 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms