Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm27187-202ENSMUST00000184873 606 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm40421-201ENSMUST00000218991 658 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Trappc3l-201ENSMUST00000095758 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC162467.2-201ENSMUST00000219397 2571 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ica1l-206ENSMUST00000191251 3415 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Stk26-202ENSMUST00000114887 3173 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
RxraP28700 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 CT010514.1-201ENSMUST00000214088 2969 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm22934-201ENSMUST00000103961 132 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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RxraP28700 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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RxraP28700 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm34597-201ENSMUST00000211189 633 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm2915-201ENSMUST00000222565 787 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC163638.1-201ENSMUST00000224818 392 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr120-201ENSMUST00000077498 993 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr285-201ENSMUST00000079736 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr78-202ENSMUST00000168007 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
RxraP28700 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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