Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm2163-201ENSMUST00000179734 2723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Morf4l2-214ENSMUST00000166930 1926 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 A330076C08Rik-202ENSMUST00000223513 1937 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rap1gds1-209ENSMUST00000200396 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 2610037D02Rik-202ENSMUST00000185067 2997 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 I830134H01Rik-202ENSMUST00000181592 2755 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm22268-201ENSMUST00000104009 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Lyg1-202ENSMUST00000114894 798 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rhox1-201ENSMUST00000115210 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zscan30-201ENSMUST00000115829 484 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12220-201ENSMUST00000118476 172 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11300-201ENSMUST00000137651 565 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm15864-201ENSMUST00000145950 369 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Nhej1-201ENSMUST00000152855 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm24039-201ENSMUST00000157878 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm17069-201ENSMUST00000172256 490 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm20508-201ENSMUST00000172480 487 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6931-202ENSMUST00000183137 1009 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm17828-201ENSMUST00000183380 799 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm27406-201ENSMUST00000184881 182 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Nanog-ps1-201ENSMUST00000188967 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm2693-201ENSMUST00000189119 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm35106-201ENSMUST00000192731 250 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr1398-ps1-201ENSMUST00000193866 929 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Lyrm1-207ENSMUST00000208202 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm44714-201ENSMUST00000208665 657 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7836-201ENSMUST00000209730 432 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm34304-201ENSMUST00000218927 1139 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC157570.2-201ENSMUST00000219091 700 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC192434.1-201ENSMUST00000225464 390 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr381-203ENSMUST00000214623 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm33543-202ENSMUST00000210336 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7203-201ENSMUST00000210880 1404 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC122346.1-201ENSMUST00000225266 3732 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4930488N15Rik-201ENSMUST00000212830 1561 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 D3Ertd751e-203ENSMUST00000108065 3452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Serpina10-201ENSMUST00000044231 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Naa20-204ENSMUST00000134759 1883 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Olfr152-203ENSMUST00000215394 2172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Vpreb1P13372 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms