Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synpo2-201ENSMUST00000051443 3719 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37150-201ENSMUST00000193900 2754 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtna-202ENSMUST00000115832 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipcef1-201ENSMUST00000078070 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rrp12-201ENSMUST00000038677 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930407I10Rik-201ENSMUST00000100396 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-31-201ENSMUST00000103511 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-37-201ENSMUST00000103514 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-42-201ENSMUST00000103516 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-43-201ENSMUST00000103517 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-75-201ENSMUST00000103544 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc18-203ENSMUST00000120866 1231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-29-201ENSMUST00000194116 342 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm33778-201ENSMUST00000216884 704 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glycam1-204ENSMUST00000228895 641 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdgf1-ps2-201ENSMUST00000074412 505 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef9-205ENSMUST00000113883 5399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drp2-204ENSMUST00000113228 3141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr30-202ENSMUST00000199348 1934 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpk-205ENSMUST00000176207 2653 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20745-201ENSMUST00000216827 3796 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfrsf23-202ENSMUST00000152703 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dalir-201ENSMUST00000188773 2170 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dixdc1-201ENSMUST00000034566 5709 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms