Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Mir7212-201ENSMUST00000184098 61 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 1700094M24Rik-201ENSMUST00000203771 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 A330008L17Rik-201ENSMUST00000064349 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Rabl3-201ENSMUST00000023524 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Tcf7l2-211ENSMUST00000111658 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm11412-201ENSMUST00000144875 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Polr2k-202ENSMUST00000180159 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm21181-201ENSMUST00000186249 330 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 AC238940.2-201ENSMUST00000224202 330 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gosr1-201ENSMUST00000010536 4289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Cdh8-207ENSMUST00000155527 3159 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm20388-201ENSMUST00000127664 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ppp2r3a-202ENSMUST00000075941 6786 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Mcf2l-208ENSMUST00000110879 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pla2g4d-201ENSMUST00000094665 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Dclk1-207ENSMUST00000198412 4282 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Spp1-201ENSMUST00000031243 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Nrep-203ENSMUST00000171533 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm15286-201ENSMUST00000150623 743 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Atg3Q9CPX6 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms