Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Srp72-201ENSMUST00000101087 3625 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Mrpl11-201ENSMUST00000025836 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Gm16188-201ENSMUST00000142019 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Tnfaip1-202ENSMUST00000108277 3768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Bdnf-206ENSMUST00000111046 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Tmem174-201ENSMUST00000050389 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Tro-205ENSMUST00000151403 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm23756-201ENSMUST00000157582 114 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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PtprtQ99M80 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprtQ99M80 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
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