Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dppa5a-201ENSMUST00000071991 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Sept14-201ENSMUST00000042266 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Myo6-205ENSMUST00000127779 4067 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 4933404O12Rik-202ENSMUST00000181190 4058 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45904-201ENSMUST00000213082 2330 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s51-201ENSMUST00000104473 123 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr329-ps-202ENSMUST00000108823 1060 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9164-201ENSMUST00000118700 1014 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 4930455G09Rik-201ENSMUST00000126231 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 A930040O22Rik-201ENSMUST00000221662 973 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkb-201ENSMUST00000040500 6373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37364-201ENSMUST00000192533 3920 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Glce-203ENSMUST00000185675 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Bambi-ps1-201ENSMUST00000121525 592 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 A530032D15Rik-203ENSMUST00000161724 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16556-201ENSMUST00000162608 471 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufa4-203ENSMUST00000204084 409 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 CT009515.2-201ENSMUST00000226126 736 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Nhlrc3Q8CCH2 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms