Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1382-201ENSMUST00000074543 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1371-201ENSMUST00000075844 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 P2rx7-204ENSMUST00000121489 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gpr68-203ENSMUST00000110066 3223 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cdc7-202ENSMUST00000076467 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cyb5d2-203ENSMUST00000156294 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cabyr-204ENSMUST00000121018 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm37178-201ENSMUST00000194962 1539 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm43119-201ENSMUST00000196957 2122 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pld5-201ENSMUST00000065967 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tcaf2-201ENSMUST00000031879 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Psen1-202ENSMUST00000101225 3023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s102-201ENSMUST00000101990 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm12079-201ENSMUST00000112483 244 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Vegfa-203ENSMUST00000113519 513 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Iqcc-202ENSMUST00000121442 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm23542-201ENSMUST00000158208 96 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm23822-201ENSMUST00000158739 128 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm22014-201ENSMUST00000158785 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rasgef1b-207ENSMUST00000166484 1296 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s101-201ENSMUST00000177910 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s114-201ENSMUST00000178297 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s119-201ENSMUST00000178861 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s127-201ENSMUST00000179185 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s129-201ENSMUST00000180122 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s131-201ENSMUST00000180280 119 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mir6239-201ENSMUST00000183564 105 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm28618-201ENSMUST00000189283 567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm37442-201ENSMUST00000191915 567 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 BC042761-201ENSMUST00000218344 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ucn3-201ENSMUST00000058610 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm15931-201ENSMUST00000118066 1852 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slc4a11-201ENSMUST00000099362 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Mpp1-201ENSMUST00000033775 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 C8b-201ENSMUST00000031663 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 Ikzf2-207ENSMUST00000190771 2483 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lrrc43Q3V0L5 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms