Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Nek6-201ENSMUST00000054234 10338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Aldoc-201ENSMUST00000017534 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Fcgr2b-202ENSMUST00000081103 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Erich3-201ENSMUST00000051862 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Sun1-206ENSMUST00000110884 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 4930528P14Rik-201ENSMUST00000152815 509 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 H2-M5-203ENSMUST00000169189 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700030L20Rik-201ENSMUST00000189233 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Pus7-206ENSMUST00000148618 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Glod4-209ENSMUST00000170710 1445 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rnf19a-201ENSMUST00000022890 4277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Cul4b-201ENSMUST00000016681 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Znf48Q3US17 Mbnl1-218ENSMUST00000194069 5460 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm42856-201ENSMUST00000200848 2852 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Zscan29-202ENSMUST00000110661 5072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm43847-201ENSMUST00000200070 1940 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ido1-201ENSMUST00000033956 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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